La Junta Directiva es el órgano que rige, administra y representa COVIDE-AMVE; está formada por el/la Presidente/a, Vicepresidente/a, Secretario/a, Tesorero/a y por no más de cuatro vocales, de entre los miembros asociados. Se reúne dos veces al año. La Comisión Delegada está formada por el Presidente, la Vicepresidenta, la Secretaria y el Tesorero; tiene facultades delegadas por la Junta Directiva para la revisión, supervisión y seguimiento más cercanos del funcionamiento de COVIDE-AMVE. El Director General tiene facultades delegadas por la Junta Directiva para llevar la dirección general de COVIDE-AMVE; ha de ser un miembro de la Congregación de la Misión o una Hija de la Caridad de San Vicente de Paúl, nombrado por la Asamblea General
